Colmena es un sistema para mejorar la performance del procesamiento de proteínas. Fue creado con el objetivo de ayudar a los investigadores de bioinformática automatizando y paralelizando tareas que realizan habitualmente en el proceso de investigación.
Autor:
García Smith, Agustín garciasmithagustin@gmail.com
Repositorio: https://gitlab.com/p-colmena
Licencia: https://gitlab.com/p-colmena/frontend/-/blob/master/LICENSE
Para utilizar esta aplicación no es necesario autenticación de ningún tipo, es su objetivo que sea utilizada libremente y que el contenido generado pueda ser utilizado por todos los que la usen. La aplicación cuenta con las siguientes características.
Es posible crear un “job” especificando las tareas que se desea realizar, actualmente es posible descargar la estructura de una proteína, medir su superficie y buscar sus pockets. Es posible visualizar los “jobs” que fueron ejecutados por la aplicación, se podrá ver el nombre que les dio el investigador, el estado del mismo (running, error, success), la fecha de inicio de ejecución y la fecha de finalización de la misma, finalmente también existe un boton que esta habilitado solo si la tarea fue finalizada, ya sea con error o con éxito.
Si un job fue finalizado con éxito se podrán ver los detalles del mismo, esto implica mostrar las tareas que fueron realizadas por este. Es desde los detalles de la ejecución de un job se podrán descargar loas archivos resultantes de esta ejecución, y también se podrá visualizar una representación del archivo en 3d. Es posible visualizar esta representación en pantalla completa y compartir la url de esta.
Tipo de trabajo: Trabajo de Inserción Profesional
Modalidad: Taller de Trabajo de Inserción Profesional
Docente: Fernando Dodino
Fecha de aprobación: 2018, segundo cuatrimestr